Точная дата строительства монастыря неизвестна. Известно только, что в 1465 году княжна Кобринская Ульяна со своим сыном Иваном Семёновичем из своих владений передали церкви Святого Спаса Кобринского монастыря мельницу на реке Шевни (приток Мухавца) с прудом и землёй и некоторое движимое имущество местным священнослужителям. В 1492 году княжна жена князя Ивана Семёновича добавила к монастырским землям село Корчицы, передала во владение две корчмы, а также часть прибыли со «всякого хлеба» и мельницы на реке Кобринка. Кроме предметов культа, в монастыре находилась библиотека с очень редкими томами: Евангелие древнего письма, окованное серебром; печатные кирилличные книги.
После подписания акта Берестейской церковной унии в 1596 году монастырь был переведён в униатство. Монастырь подвергался разрушению во время боевых действий и грабежей, неоднократно был перестроен. В 1839 году, после отмены унии, монастырь был закрыт. В зданиях располагалось духовное училище. Главный корпус монастыря стоял в запустении до 20-х годов XX века, когда здание было отремонтировано по приказу польских властей. В ходе работ были найдены остатки захоронений кобринских князей а также замурованные в стенах скелеты в оковах. В отремонтированном здании разместился суд Кобринского повета.
