В 1810 году отношения между Францией и Россией начали ухудшаться. Перспектива войны с каждым месяцем казалась все более неизбежной. Тогда Александр I – государь-император и самодержец Всероссийский принимает решение начать процесс вооружения страны – в частности, западных рубежей. Военное министерство командирует инженеров в разные губернии Российской империи для поиска мест, наиболее удобных для размещения оборонительных укреплений. Инженер-порутчик Теодор Нарбут предложил построить крепость на территории Бобруйска. В конце июня 1810 года император Александр I утвердил план Бобруйской крепости: под укрепление отходила вся территория исторически сложившегося города на правом берегу Березины, местные жители получали свободную землю вокруг крепости, где были запроектированы форштадты.
Однако есть историки, которые связывают появление оборонительного укрепления в Бобруйске с именем Екатерины II. Они полагают, что, совершая поездку по белорусским землям, императрица отметила удобное расположение Бобруйска и решила создать в городе перевалочную базу для русской армии.
Официальной датой заложения Бобруйской крепости считается 4 июня 1810 года. При ее строительстве максимально использовались старинные каменные здания Бобруйска. Работы велись интенсивно. Здесь были насыпаны валы, построены 8 бастионов, сделаны земляные укрепления, а также сооружена часть внутренних застроек. В итоге к концу 1811 года все форты крепости обладали внушительной оборонительной силой. Оборонительное укрепление в Бобруйске считалось одним из лучших в то время. К началу войны 1812 года на вооружение крепости было поставлено около 300 орудий. Размещенный в ней гарнизон насчитывал около 4 тысяч человек. Крепость стала важным опорным пунктом русской армии на пути южного фланга наполеоновских войск. В начале войны 1812 года она помогла 2-й Западной армии Петра Багратиона соединиться с 1-й армией под командованием Барклая де Толли, которая находилась в Смоленске. Здесь военные смогли пополнить свои запасы продовольствия, получить подкрепление, оставить больных и раненых.
После войны строительство крепости продолжилось. Увеличилась ее территория, появились дополнительные укрепления, а также прямые улицы и бульвары. Архитектором новых зданий крепости стал А. Штауберт, который следовал традициям классицизма. Здесь появился архитектурный ансамбль Соборной площади с домом коменданта, зданиями штаба, госпиталя и собором Александра Невского.
Судьба Бобруйской крепости тесно связана с декабристами. Здесь была расквартирована 9-я пехотная дивизия, среди офицеров которой были члены тайных обществ. Именно в крепости был разработан «Бобруйский план» вооруженного восстания, который предусматривал арест императора Александра I во время смотра войск. После подавления декабрьского восстания на Сенатской площади в Петербурге здесь отбывали наказание В.Дивов, М.Бодиско, С.Трусов, В.Норов и другие.
Начиная с 1886 года, крепость понемногу начинает утрачивать свое стратегическое значение и в итоге превращается в склад.
В годы Великой Отечественной войны немецко-фашистские захватчики организовали в крепости крупный концентрационный лагерь для советских военнопленных.
В 2002 году памятник истории и архитектуры «Бобруйская крепость» внесен в Государственный список историко-культурных ценностей Республики Беларусь, отнесен к ценностям, имеющим республиканское значение.
