Храм был сильно повреждён по время Первой Мировой войны. После вхождения территории Западной Беларуси в состав Польши, костёл был отреставрирован в 1929—1930 годах.
После Второй Мировой войны католический приход в Пружанах перестал действовать и в 1951 году в здании храма разместился Дом культуры. Обстановка костёла была уничтожена.
В 1993 г. здание костёла было возвращено католикам, после чего была проведена реставрация. В 1998 г. храм был повторно освящён и открыт для посещения.
